Teisipäev, 31. detsember 2013.- Esmakordselt on teadlased hakanud kombineerima arvutamist ja genoomiteavet, et ennustada olemasolevate ravimite uut kasutamist. Riikliku terviseinstituudi (NIH) rahastatud arvutusuuringus on analüüsitud genoomi ja farmakoloogilisi andmeid, et ennustada uute ravimite kasutamist, mis on juba turul. Teadlased eesotsas dr. Atul J. Butte'iga Californias Stanfordi ülikoolist on teatanud oma tulemustest kahes artiklis viimases väljaandes "Science Translatiivne Meditsiin". "Uue ravimi turule toomine maksab tavaliselt umbes miljard dollarit ning paljude aastate pikkune uurimis- ja arendustegevus, " ütleb NIH farmakogenoomika uurimisvõrgustiku direktor dr Rochelle M. Long, "kui leiame võimalusi ravimite taaskasutamiseks, mis juba heaks kiidetud, saaks olemasolevaid ravimeetodeid täiustada ning aega ja raha kokku hoida. "
Teadlased kaevandasid oma andmed geeniekspressiooni Omnibus'ist (Riiklikust Biotehnoloogia Teabekeskusest) - avalikust andmebaasist, mis sisaldab tuhandete genoomiuuringute tulemusi väga erinevates valdkondades ja mida tutvustavad teadlased kogu maailmas.
Butte grupp keskendus 100 haigusele ja 164 ravimile, luues arvutiprogrammi tuhandete võimalike ravimite ja haiguste kombinatsioonide, ravimite ja haiguste otsimiseks, mille geeniekspressioonimustrid üksteist tühistavad. Näiteks kui haigus suurendab teatud geenide aktiivsust, proovib programm seda sobitada ühe või mitme ravimiga, mis seda aktiivsust vähendavad.
Paljud ravimite ja haiguste kombinatsioonid on teada ja on kliinilises kasutuses, toetades selle lähenemisviisi kehtivust. Näiteks ennustas analüüs õigesti, et prednisoloon võib ravida Crohni tõbe - haigust, mille jaoks see ravim on standardne ravi.
Muud kombinatsioonid on olnud uudsed ja üllatavad: haavandite raviks ette nähtud ravim (tsimetidiin) langes kokku kopsuvähiga ja krambivastane aine (topiramaat) langes kokku põletikulise soolehaigusega - mis hõlmab ka Crohni tõbe.
Tsimetidiini seose tuvastamiseks kopsuvähiga testis meeskond seda ravimit inimese kopsuvähirakkudes laboris ja hiirtele siirdatud rakkudes. Mõlemal juhul aeglustas ravim vähirakkude kasvu võrreldes kontrollrühmaga (rakud või hiired), kes polnud tsimetidiini saanud.
Testimaks, kas krambivastane topiramaat avaldab mõju põletikulistele soolehaigustele, manustasid teadlased ravimit rottidele, kellel olid sellise soolehaiguse sümptomid: kõhulahtisus, põletik, haavandid ja käärsoole mikroskoopiline kahjustus. Ravim vähendas kõiki neid sümptomeid, mõnikord isegi paremini kui prednisoloon.
Lisaks märkisid teadlased, et analüüsis on rühmitatud sarnaste molekulaarsete protsessidega haigused (näiteks need, mis mõjutavad immuunsussüsteemi). Nii toimisid sarnase toimega ravimid (näiteks need, mis aeglustavad rakkude jagunemist). Teadlased usuvad, et nende ootamatute rühmituste liikmeid uurides võiksid nad rohkem teada saada teatud haiguste kulgemisest ja mõnede ravimite toimimisest molekulaarsel tasemel.
Longi sõnul "" see uurimistöö on alles algusjärgus, kuid see on lootustandv meetod loominguliseks, kiireks ja taskukohaseks lähenemiseks, kui on vaja leida uusi ravimeid, mida meil juba on meie terapeutilises arsenalis ".
Allikas:
Silte:
Väljaregistreerimisel Psühholoogia Erinev
Teadlased kaevandasid oma andmed geeniekspressiooni Omnibus'ist (Riiklikust Biotehnoloogia Teabekeskusest) - avalikust andmebaasist, mis sisaldab tuhandete genoomiuuringute tulemusi väga erinevates valdkondades ja mida tutvustavad teadlased kogu maailmas.
Butte grupp keskendus 100 haigusele ja 164 ravimile, luues arvutiprogrammi tuhandete võimalike ravimite ja haiguste kombinatsioonide, ravimite ja haiguste otsimiseks, mille geeniekspressioonimustrid üksteist tühistavad. Näiteks kui haigus suurendab teatud geenide aktiivsust, proovib programm seda sobitada ühe või mitme ravimiga, mis seda aktiivsust vähendavad.
Paljud ravimite ja haiguste kombinatsioonid on teada ja on kliinilises kasutuses, toetades selle lähenemisviisi kehtivust. Näiteks ennustas analüüs õigesti, et prednisoloon võib ravida Crohni tõbe - haigust, mille jaoks see ravim on standardne ravi.
Muud kombinatsioonid on olnud uudsed ja üllatavad: haavandite raviks ette nähtud ravim (tsimetidiin) langes kokku kopsuvähiga ja krambivastane aine (topiramaat) langes kokku põletikulise soolehaigusega - mis hõlmab ka Crohni tõbe.
Tsimetidiini seose tuvastamiseks kopsuvähiga testis meeskond seda ravimit inimese kopsuvähirakkudes laboris ja hiirtele siirdatud rakkudes. Mõlemal juhul aeglustas ravim vähirakkude kasvu võrreldes kontrollrühmaga (rakud või hiired), kes polnud tsimetidiini saanud.
Testimaks, kas krambivastane topiramaat avaldab mõju põletikulistele soolehaigustele, manustasid teadlased ravimit rottidele, kellel olid sellise soolehaiguse sümptomid: kõhulahtisus, põletik, haavandid ja käärsoole mikroskoopiline kahjustus. Ravim vähendas kõiki neid sümptomeid, mõnikord isegi paremini kui prednisoloon.
Lisaks märkisid teadlased, et analüüsis on rühmitatud sarnaste molekulaarsete protsessidega haigused (näiteks need, mis mõjutavad immuunsussüsteemi). Nii toimisid sarnase toimega ravimid (näiteks need, mis aeglustavad rakkude jagunemist). Teadlased usuvad, et nende ootamatute rühmituste liikmeid uurides võiksid nad rohkem teada saada teatud haiguste kulgemisest ja mõnede ravimite toimimisest molekulaarsel tasemel.
Longi sõnul "" see uurimistöö on alles algusjärgus, kuid see on lootustandv meetod loominguliseks, kiireks ja taskukohaseks lähenemiseks, kui on vaja leida uusi ravimeid, mida meil juba on meie terapeutilises arsenalis ".
Allikas: